More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10890 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3819  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.59 
 
 
667 aa  800    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490579  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.64 
 
 
636 aa  775    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1056  acyl-CoA dehydrogenase  67.83 
 
 
624 aa  815    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00257897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0532  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.44 
 
 
623 aa  787    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00508335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3042  acyl-CoA dehydrogenase-like  63.61 
 
 
636 aa  775    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699042  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10890  acyl-CoA dehydrogenase fadE10  100 
 
 
650 aa  1316    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000443357  normal  0.855053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0845  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.56 
 
 
650 aa  820    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533376  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2552  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.85 
 
 
648 aa  713    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3742  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.38 
 
 
666 aa  855    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3944  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.61 
 
 
661 aa  857    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.22 
 
 
646 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1417  Acyl-CoA dehydrogenase  51.58 
 
 
649 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2443  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.57 
 
 
648 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221284  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2603  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.26 
 
 
633 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197382  normal  0.147654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2419  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.85 
 
 
648 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.276464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4277  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.67 
 
 
579 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.943677  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1974  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.99 
 
 
673 aa  276  8e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4118  Acyl-CoA dehydrogenase  34.91 
 
 
580 aa  270  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846783  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.91 
 
 
580 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4249  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.91 
 
 
580 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.808927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1555  Acyl-CoA dehydrogenase  31.38 
 
 
639 aa  262  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0095841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.8 
 
 
379 aa  233  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.29 
 
 
386 aa  227  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  37.05 
 
 
384 aa  224  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.05 
 
 
384 aa  224  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3642  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.23 
 
 
384 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43420  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.95 
 
 
384 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0779209  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.83 
 
 
380 aa  220  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  35.79 
 
 
379 aa  220  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.41 
 
 
386 aa  220  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.88 
 
 
376 aa  219  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  35.26 
 
 
379 aa  219  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.44 
 
 
379 aa  217  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.91 
 
 
379 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0220  acyl-CoA dehydrogenase  35.75 
 
 
384 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0793985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.73 
 
 
388 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.06 
 
 
377 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.46 
 
 
388 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.52 
 
 
382 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.51 
 
 
389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
381 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.94 
 
 
384 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
376 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
376 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.72 
 
 
402 aa  213  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  37.33 
 
 
377 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.84 
 
 
385 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.73 
 
 
377 aa  213  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
381 aa  213  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
376 aa  213  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
376 aa  213  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.36 
 
 
386 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.94 
 
 
383 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.84 
 
 
385 aa  213  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3492  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.39 
 
 
383 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.94 
 
 
377 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.68 
 
 
379 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1088  acyl-CoA dehydrogenase  36.34 
 
 
380 aa  212  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
376 aa  212  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  34.99 
 
 
380 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.94 
 
 
377 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
376 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0176  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.64 
 
 
385 aa  212  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142689  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  34.18 
 
 
381 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7329  Acyl-CoA dehydrogenase  36.21 
 
 
383 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  37.54 
 
 
377 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1803  acyl-CoA dehydrogenase  38.33 
 
 
377 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.82 
 
 
377 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.82 
 
 
377 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.38 
 
 
375 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.54 
 
 
377 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.46 
 
 
376 aa  210  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.49 
 
 
375 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2885  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.5 
 
 
383 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.93 
 
 
375 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.1 
 
 
377 aa  210  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  34.54 
 
 
379 aa  210  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.93 
 
 
380 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0918  acyl-CoA dehydrogenase  39.17 
 
 
377 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2279  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.11 
 
 
383 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.54 
 
 
377 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2178  acyl-CoA dehydrogenase  38.89 
 
 
377 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480909  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.1 
 
 
386 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  33.59 
 
 
379 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0826  acyl-CoA dehydrogenase  38.89 
 
 
377 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.18 
 
 
381 aa  209  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  35.1 
 
 
379 aa  208  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34.17 
 
 
379 aa  208  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.08 
 
 
379 aa  208  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.65 
 
 
375 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3574  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.67 
 
 
377 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.65 
 
 
375 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.28 
 
 
394 aa  206  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  36.11 
 
 
378 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  35 
 
 
380 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.1 
 
 
375 aa  206  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0428  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.84 
 
 
380 aa  205  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.871589  normal  0.2576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.67 
 
 
377 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.44 
 
 
388 aa  205  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  36.67 
 
 
377 aa  205  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0155468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>