More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3042 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0845  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.86 
 
 		 650 aa  804    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533376  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2552  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  61.98 
 
 		 648 aa  772    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1056  acyl-CoA dehydrogenase  62.36 
 
 		 624 aa  728    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00257897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0532  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.5 
 
 		 623 aa  734    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00508335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3042  acyl-CoA dehydrogenase-like  100 
 
 		 636 aa  1269    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10890  acyl-CoA dehydrogenase fadE10  63.61 
 
 		 650 aa  770    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000443357  normal  0.855053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  92.92 
 
 		 636 aa  1190    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3742  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  61.39 
 
 		 666 aa  713    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3944  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.08 
 
 		 661 aa  720    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3819  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.56 
 
 		 667 aa  739    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490579  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2419  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.94 
 
 		 648 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1417  Acyl-CoA dehydrogenase  52.48 
 
 		 649 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.99 
 
 		 646 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2443  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.32 
 
 		 648 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221284  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2603  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.1 
 
 		 633 aa  556  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197382  normal  0.147654 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1974  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.69 
 
 		 673 aa  316  7e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4277  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.52 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.943677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4118  Acyl-CoA dehydrogenase  34.01 
 
 		 580 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846783  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.05 
 
 		 580 aa  270  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4249  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.05 
 
 		 580 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.808927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1555  Acyl-CoA dehydrogenase  30.41 
 
 		 639 aa  249  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0095841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.97 
 
 		 388 aa  223  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.64 
 
 		 375 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.64 
 
 		 379 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.46 
 
 		 386 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.37 
 
 		 375 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.37 
 
 		 375 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.55 
 
 		 389 aa  219  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.95 
 
 		 386 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.73 
 
 		 394 aa  217  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  36.11 
 
 		 378 aa  216  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.92 
 
 		 375 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.84 
 
 		 377 aa  216  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.11 
 
 		 375 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3010  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.99 
 
 		 387 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.157219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.66 
 
 		 375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.77 
 
 		 376 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.92 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  33.96 
 
 		 379 aa  213  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.17 
 
 		 375 aa  213  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4666  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.77 
 
 		 375 aa  212  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43420  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.76 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0779209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  36.77 
 
 		 375 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  36.77 
 
 		 375 aa  211  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.87 
 
 		 377 aa  211  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.6 
 
 		 382 aa  211  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.97 
 
 		 381 aa  211  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  33.33 
 
 		 379 aa  211  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  37.6 
 
 		 377 aa  210  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3642  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.5 
 
 		 384 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.9 
 
 		 377 aa  210  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.9 
 
 		 377 aa  210  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2548  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.06 
 
 		 375 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  34.4 
 
 		 379 aa  209  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  36.46 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  35.11 
 
 		 381 aa  209  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.8 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.84 
 
 		 381 aa  208  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.27 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.75 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  34.83 
 
 		 381 aa  207  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.6 
 
 		 402 aa  207  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  34.83 
 
 		 376 aa  207  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0220  acyl-CoA dehydrogenase  35.53 
 
 		 384 aa  206  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0793985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  34.83 
 
 		 376 aa  207  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  34.83 
 
 		 376 aa  207  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2906  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.97 
 
 		 375 aa  207  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.77 
 
 		 388 aa  206  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3106  acyl-CoA dehydrogenase-like  36.31 
 
 		 375 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  34.83 
 
 		 381 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2482  butyryl-CoA dehydrogenase  37.7 
 
 		 395 aa  206  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  34.83 
 
 		 376 aa  206  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.38 
 
 		 380 aa  206  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  34.83 
 
 		 376 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.56 
 
 		 377 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  34.83 
 
 		 376 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.1 
 
 		 377 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.77 
 
 		 379 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.56 
 
 		 377 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.25 
 
 		 384 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0176  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.13 
 
 		 385 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  35.29 
 
 		 377 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3574  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.11 
 
 		 377 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  35.37 
 
 		 379 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.44 
 
 		 376 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05570  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  37.85 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.41 
 
 		 379 aa  205  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3492  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35 
 
 		 383 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2128  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.4 
 
 		 592 aa  204  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.23514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35 
 
 		 383 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2885  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.28 
 
 		 383 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4367  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.54 
 
 		 418 aa  203  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.29 
 
 		 377 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  34.61 
 
 		 384 aa  203  8e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.51 
 
 		 381 aa  203  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  35.29 
 
 		 377 aa  203  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.29 
 
 		 377 aa  203  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.29 
 
 		 386 aa  203  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  33.6 
 
 		 380 aa  203  9e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.19 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>