41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2031 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  400  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  60.2 
 
 		 196 aa  267  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  59.69 
 
 		 200 aa  254  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  59.69 
 
 		 200 aa  254  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  58.89 
 
 		 197 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  51.46 
 
 		 188 aa  190  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  55.17 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  47.83 
 
 		 191 aa  186  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  47.37 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  50.54 
 
 		 197 aa  181  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  39.66 
 
 		 179 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  38.6 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  39.88 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  36.84 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  36.36 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  34.22 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  37.57 
 
 		 173 aa  121  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  33.14 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  33.14 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  31.21 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03401  phycoerythrin linker protein CpeS  30.11 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.000238694  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0424  hypothetical protein  29.26 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  29.24 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  27.75 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0308  phycoerythrin linker protein CpeS-like  28.98 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.244781  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  30.56 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03301  phycoerythrin linker protein CpeS  28.41 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.21635  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03311  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  28.41 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.449065  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03381  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  27.17 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0364  hypothetical protein  29.03 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.347642 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03911  phycoerythrin linker protein CpeS  24.36 
 
 		 161 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142306  normal  0.0710975 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  29.7 
 
 		 164 aa  72  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0182  hypothetical protein  30.19 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0177  hypothetical protein  30.19 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00664238  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0543  hypothetical protein  30.38 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22301  phycoerythrin linker protein CpeS  24.38 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2542  hypothetical protein  28.66 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1048  hypothetical protein  27.56 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.48035  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0161  hypothetical protein  25.88 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4989  hypothetical protein  23.46 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1167  hypothetical protein  23.87 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.683813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>