33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1677 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  100 
 
 		 177 aa  352  1e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03911  phycoerythrin linker protein CpeS  96.27 
 
 		 161 aa  309  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142306  normal  0.0710975 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03381  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  47.98 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  40.68 
 
 		 178 aa  147  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22301  phycoerythrin linker protein CpeS  43.64 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  39.2 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  40.74 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  38.42 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  33.52 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03401  phycoerythrin linker protein CpeS  40.57 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.000238694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  35.84 
 
 		 191 aa  112  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  36 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  34.68 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0308  phycoerythrin linker protein CpeS-like  38.73 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.244781  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03301  phycoerythrin linker protein CpeS  37.57 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.21635  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03311  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  37.57 
 
 		 182 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.449065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  29.48 
 
 		 196 aa  95.5  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  27.75 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  32.2 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  29.71 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  29.38 
 
 		 200 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  29.38 
 
 		 200 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  29.14 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  27.43 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0424  hypothetical protein  29.89 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  31.61 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  29.55 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  29.55 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  27.43 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  27.93 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  27.43 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  26.59 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0364  hypothetical protein  20.39 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.347642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>