23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0161 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0161  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  367  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  36.61 
 
 
176 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  36.61 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  36.61 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  31.95 
 
 
172 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  36 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  31.79 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  28.82 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  28.82 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  27.65 
 
 
197 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  27.75 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0889  hypothetical protein  34.38 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.438854  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  29.71 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  25.58 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  24.14 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  25.88 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  25.29 
 
 
194 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  29.14 
 
 
173 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1509  hypothetical protein  29.01 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  25.14 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  48.28 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  38.6 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>