41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3908 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  411  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  64.8 
 
 
200 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  64.8 
 
 
200 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  60.2 
 
 
193 aa  267  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  61.05 
 
 
197 aa  260  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  53.3 
 
 
188 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  51.91 
 
 
191 aa  202  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  53.49 
 
 
188 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  46.19 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  44.1 
 
 
197 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  39.11 
 
 
179 aa  154  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  38.73 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  38.07 
 
 
177 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  39.31 
 
 
197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  36.36 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  37.78 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  35.84 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  32.95 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  111  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0424  hypothetical protein  31.98 
 
 
203 aa  104  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  29.48 
 
 
177 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0308  phycoerythrin linker protein CpeS-like  31.17 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.244781  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03401  phycoerythrin linker protein CpeS  30.13 
 
 
183 aa  85.1  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.000238694  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03381  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  29.55 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03301  phycoerythrin linker protein CpeS  30.52 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.21635  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03911  phycoerythrin linker protein CpeS  26.92 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142306  normal  0.0710975 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03311  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  31.17 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.449065  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0364  hypothetical protein  32.26 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.347642 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  27.33 
 
 
164 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22301  phycoerythrin linker protein CpeS  26.25 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0182  hypothetical protein  28.93 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0177  hypothetical protein  28.93 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00664238  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0161  hypothetical protein  27.75 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2542  hypothetical protein  28.66 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831139  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0543  hypothetical protein  27.39 
 
 
179 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1048  hypothetical protein  27.39 
 
 
186 aa  51.2  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.48035  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1167  hypothetical protein  23.13 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.683813  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4989  hypothetical protein  24.53 
 
 
186 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>