41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4111 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  66.32 
 
 
197 aa  290  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  67.36 
 
 
194 aa  290  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0424  hypothetical protein  43.55 
 
 
203 aa  190  9e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  42.62 
 
 
205 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  38.46 
 
 
191 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  38.6 
 
 
193 aa  143  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  38.73 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  37.28 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  38.6 
 
 
197 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  39.88 
 
 
200 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  39.88 
 
 
200 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  37.28 
 
 
188 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  34.09 
 
 
176 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  33.71 
 
 
179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  34.09 
 
 
176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  36.47 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  32.77 
 
 
177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  31.72 
 
 
197 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  32.52 
 
 
172 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  32.2 
 
 
177 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  31.4 
 
 
173 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  30.36 
 
 
198 aa  88.6  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  29.78 
 
 
178 aa  82  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0308  phycoerythrin linker protein CpeS-like  30.05 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.244781  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03911  phycoerythrin linker protein CpeS  29.38 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142306  normal  0.0710975 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  25.45 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22301  phycoerythrin linker protein CpeS  28.3 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03381  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  28.12 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03401  phycoerythrin linker protein CpeS  27.93 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.000238694  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03311  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  31.15 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.449065  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03301  phycoerythrin linker protein CpeS  30.98 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.21635  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0364  hypothetical protein  25.95 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.347642 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0161  hypothetical protein  25.58 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0182  hypothetical protein  25.15 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0177  hypothetical protein  25.15 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00664238  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1048  hypothetical protein  24.83 
 
 
186 aa  47.8  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.48035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0543  hypothetical protein  23.75 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1167  hypothetical protein  24.03 
 
 
185 aa  45.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.683813  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2542  hypothetical protein  24.1 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831139  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4989  hypothetical protein  21.57 
 
 
186 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>