35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0571 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  54.91 
 
 
176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  54.91 
 
 
176 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  43.79 
 
 
191 aa  157  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  44.38 
 
 
188 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  43.2 
 
 
188 aa  154  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  41.86 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  38.1 
 
 
200 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  38.1 
 
 
200 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  34.5 
 
 
197 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  32.95 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  31.21 
 
 
193 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  36.05 
 
 
177 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  32.96 
 
 
179 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  32.52 
 
 
193 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0161  hypothetical protein  31.95 
 
 
180 aa  90.9  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  31.98 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  29.63 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  28.05 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  28.65 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22301  phycoerythrin linker protein CpeS  29.38 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0424  hypothetical protein  23.67 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  28.4 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  28.92 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03401  phycoerythrin linker protein CpeS  26.7 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.000238694  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0308  phycoerythrin linker protein CpeS-like  27.68 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.244781  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  26.04 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  26.59 
 
 
177 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  27.22 
 
 
197 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03311  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  25.58 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.449065  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03301  phycoerythrin linker protein CpeS  26.55 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.21635  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03911  phycoerythrin linker protein CpeS  26.42 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142306  normal  0.0710975 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03381  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  23.43 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0182  hypothetical protein  26.38 
 
 
180 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0177  hypothetical protein  26.38 
 
 
180 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00664238  normal  0.338946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>