41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1352 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  68.37 
 
 
197 aa  298  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  64.8 
 
 
196 aa  280  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  59.69 
 
 
193 aa  254  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  57.06 
 
 
188 aa  207  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  55.17 
 
 
188 aa  204  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  52.3 
 
 
191 aa  196  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  49 
 
 
198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  47.52 
 
 
197 aa  188  4e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  38.95 
 
 
179 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  39.88 
 
 
193 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  39.53 
 
 
177 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  37.5 
 
 
197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  41.48 
 
 
174 aa  132  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  38.1 
 
 
176 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  38.1 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  37.79 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  33.88 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  35.71 
 
 
194 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  38.1 
 
 
172 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0424  hypothetical protein  31.77 
 
 
203 aa  111  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03401  phycoerythrin linker protein CpeS  29.38 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.000238694  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0308  phycoerythrin linker protein CpeS-like  28.75 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.244781  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  32.04 
 
 
178 aa  87  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  29.38 
 
 
177 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03301  phycoerythrin linker protein CpeS  29.38 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.21635  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03311  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  30 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.449065  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03381  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  29.19 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2542  hypothetical protein  29.38 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0182  hypothetical protein  29.01 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03911  phycoerythrin linker protein CpeS  26.42 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142306  normal  0.0710975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0177  hypothetical protein  29.01 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00664238  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0364  hypothetical protein  30 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.347642 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0161  hypothetical protein  28.82 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  26.99 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22301  phycoerythrin linker protein CpeS  24.84 
 
 
161 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1048  hypothetical protein  28.85 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.48035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0543  hypothetical protein  28.03 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1167  hypothetical protein  24.49 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.683813  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4989  hypothetical protein  23.42 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>