35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0424 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0424  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  71.81 
 
 		 205 aa  300  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  45.5 
 
 		 197 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  43.55 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  43.62 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  34.9 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  31.36 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  31.77 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  31.77 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  32.16 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  31.98 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  29.26 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  30.73 
 
 		 177 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  30.73 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  24.86 
 
 		 176 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  24.86 
 
 		 176 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  27.01 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  30.29 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  25.88 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  29.79 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22301  phycoerythrin linker protein CpeS  29.49 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  31.45 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  29.89 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03381  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  26.44 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  27.53 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03911  phycoerythrin linker protein CpeS  29.3 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142306  normal  0.0710975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  23.67 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0308  phycoerythrin linker protein CpeS-like  27.68 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.244781  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03401  phycoerythrin linker protein CpeS  25.71 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.000238694  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03311  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  25.97 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.449065  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03301  phycoerythrin linker protein CpeS  24.73 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.21635  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0182  hypothetical protein  22.64 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0177  hypothetical protein  22.64 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00664238  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1048  hypothetical protein  22.84 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.48035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>