28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0543 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0543  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0177  hypothetical protein  64.8 
 
 
180 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00664238  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0182  hypothetical protein  64.8 
 
 
180 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2542  hypothetical protein  59.77 
 
 
178 aa  213  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831139  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1048  hypothetical protein  56.9 
 
 
186 aa  212  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.48035  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0364  hypothetical protein  60.61 
 
 
183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.347642 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  30.38 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  30.38 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  30.23 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  29.41 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  26.11 
 
 
197 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  27.63 
 
 
197 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  27.39 
 
 
196 aa  58.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  27.85 
 
 
191 aa  57.8  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  28.03 
 
 
200 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  28.03 
 
 
200 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  26.44 
 
 
194 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  25.75 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  25.32 
 
 
179 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  23.93 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  23.23 
 
 
178 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  25.66 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  26.92 
 
 
176 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  26.92 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  23.75 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  23.9 
 
 
205 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  25.32 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  26.76 
 
 
164 aa  42  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>