37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_03401 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_03401  phycoerythrin linker protein CpeS  100 
 
 
183 aa  362  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.000238694  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0308  phycoerythrin linker protein CpeS-like  66.12 
 
 
183 aa  245  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.244781  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03301  phycoerythrin linker protein CpeS  63.93 
 
 
183 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.21635  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03311  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  63.93 
 
 
182 aa  228  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.449065  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  36.93 
 
 
178 aa  124  7e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03381  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  39.31 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  40.57 
 
 
177 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22301  phycoerythrin linker protein CpeS  40.37 
 
 
161 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  34.48 
 
 
173 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  30.11 
 
 
193 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  34.29 
 
 
177 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  38.41 
 
 
164 aa  97.8  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03911  phycoerythrin linker protein CpeS  38.36 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142306  normal  0.0710975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  31.79 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  30.11 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  29.48 
 
 
188 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  30.06 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  32.18 
 
 
191 aa  92.8  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  30.64 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  29.38 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  29.38 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  30.13 
 
 
196 aa  85.1  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  28.03 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  28.25 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  27.93 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  28.8 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  26.7 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0424  hypothetical protein  25.71 
 
 
203 aa  64.3  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  28.49 
 
 
197 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  25 
 
 
174 aa  62  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  24.57 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  24.57 
 
 
176 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1048  hypothetical protein  24.03 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.48035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2542  hypothetical protein  23.68 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0182  hypothetical protein  24.18 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0177  hypothetical protein  24.18 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00664238  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1167  hypothetical protein  22.36 
 
 
185 aa  41.6  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.683813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>