35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_03301 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_03301  phycoerythrin linker protein CpeS  100 
 
 
183 aa  362  2e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.21635  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0308  phycoerythrin linker protein CpeS-like  89.62 
 
 
183 aa  324  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.244781  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03311  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  95.63 
 
 
182 aa  320  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.449065  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03401  phycoerythrin linker protein CpeS  63.93 
 
 
183 aa  237  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.000238694  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1886  hypothetical protein  39.55 
 
 
178 aa  125  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.049709  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22301  phycoerythrin linker protein CpeS  38.18 
 
 
161 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4527  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  33.14 
 
 
179 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.447395  normal  0.851635 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5723  putative phycoerythrin-associated linker protein, CpeS  34.68 
 
 
177 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1677  CpeS-like protein  37.57 
 
 
177 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0252305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4106  putative phycoerythrin-associated linker protein  32.56 
 
 
173 aa  104  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.954275  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3509  hypothetical protein  33.11 
 
 
197 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0441  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  95.9  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0546909  normal  0.625077 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03911  phycoerythrin linker protein CpeS  37.11 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142306  normal  0.0710975 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03381  phycoerythrin linker protein CpeS-like protein  34.88 
 
 
178 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2031  hypothetical protein  28.41 
 
 
193 aa  90.9  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1709  hypothetical protein  31.58 
 
 
191 aa  89.4  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3908  hypothetical protein  30.52 
 
 
196 aa  88.6  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2286  hypothetical protein  30.77 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.122253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1352  hypothetical protein  29.38 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4549  hypothetical protein  29.24 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1382  hypothetical protein  29.38 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2083  hypothetical protein  27.81 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0400  hypothetical protein  28.33 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4111  hypothetical protein  30.98 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0571  hypothetical protein  26.55 
 
 
172 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1905  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  61.6  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.876668  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4521  hypothetical protein  25.82 
 
 
194 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5736  hypothetical protein  27.37 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0424  hypothetical protein  24.73 
 
 
203 aa  55.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3198  hypothetical protein  24.86 
 
 
174 aa  54.7  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0243175  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1416  hypothetical protein  24.57 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1382  hypothetical protein  24.57 
 
 
176 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1167  hypothetical protein  23.57 
 
 
185 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.683813  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1048  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.48035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2542  hypothetical protein  21.71 
 
 
178 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831139  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>