70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3360 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3360  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  30.5 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  29.6 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  30.69 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  30.57 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  28.06 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  28.31 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  28.46 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  27.91 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  29.1 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  30.96 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  30.14 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  28.88 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  27.31 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  25.56 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  28.45 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  25 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  29.54 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  27.9 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  28.46 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  28.45 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  27.93 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  29.93 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  27.47 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  25.7 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  30 
 
 		 267 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  27.27 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  27.04 
 
 		 240 aa  52  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  35.09 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  31.34 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  32.76 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  25.57 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  22.68 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  25.37 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  27.52 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  30.14 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  30.14 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  32 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  34.29 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  28.08 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  32.65 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  30.65 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  34 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  29.45 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  23.29 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  32.2 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  27.09 
 
 		 227 aa  45.4  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  33.67 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  25.11 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  23.74 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  26.75 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  27.54 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  32.65 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  27.08 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  27.22 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  31.09 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  31.36 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  30.36 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  26.67 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  25.69 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  26.71 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  35.19 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  25.91 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  29.66 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  30.83 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  28.81 
 
 		 230 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  28.81 
 
 		 230 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  28.81 
 
 		 230 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  24.23 
 
 		 235 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>