40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3079 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3079  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000072399  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2478  hypothetical protein  85.77 
 
 		 260 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0204339  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1571  hypothetical protein  80.38 
 
 		 260 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00119442  hitchhiker  0.0000757422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2652  hypothetical protein  80.38 
 
 		 260 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00434013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2425  hypothetical protein  76.54 
 
 		 260 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000158594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1254  hypothetical protein  74.62 
 
 		 260 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  unclonable  0.0000112566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2626  hypothetical protein  75.38 
 
 		 260 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1625  hypothetical protein  75 
 
 		 260 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00789823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1517  hypothetical protein  74.23 
 
 		 260 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00311608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1662  hypothetical protein  74.62 
 
 		 260 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000135099  normal  0.141207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1640  hypothetical protein  74.62 
 
 		 260 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2464  hypothetical protein  74.62 
 
 		 260 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.00000305564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2534  hypothetical protein  74.62 
 
 		 260 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000115095  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2718  hypothetical protein  75 
 
 		 260 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  hitchhiker  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2626  hypothetical protein  74.62 
 
 		 260 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1824  hypothetical protein  72.27 
 
 		 221 aa  332  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2990  hypothetical protein  47.64 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3756  hypothetical protein  46.51 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0606  hypothetical protein  34.66 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00011128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1060  hypothetical protein  36.36 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0352  TonB system biopolymer transport component  35.71 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.168903  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00637  hypothetical protein  32.52 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3872  hypothetical protein  39.73 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001856  TonB system biopolymer transport component  32.11 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3976  hypothetical protein  32.41 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03435  TonB system biopolymer transport component  32.39 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0905  hypothetical protein  34.06 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0111  hypothetical protein  34.27 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1154  hypothetical protein  35.48 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0868  hypothetical protein  33.48 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06760  hypothetical protein  31.82 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02814  TonB system biopolymer transport component  47.9 
 
 		 118 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000400014  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000848  TonB system biopolymer transport component  32.79 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2152  hypothetical protein  29.96 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.48065  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1615  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0435  hypothetical protein  35.82 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0849  hypothetical protein  25.91 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.14 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3525  hypothetical protein  28.06 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0452  hypothetical protein  32.37 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0923932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>