41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1060 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1060  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03435  TonB system biopolymer transport component  75.3 
 
 		 252 aa  393  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3976  hypothetical protein  50.39 
 
 		 273 aa  272  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0606  hypothetical protein  45.78 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00011128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001856  TonB system biopolymer transport component  41.13 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00637  hypothetical protein  41.06 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0352  TonB system biopolymer transport component  43.32 
 
 		 260 aa  204  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.168903  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3872  hypothetical protein  39.45 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1571  hypothetical protein  37.27 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00119442  hitchhiker  0.0000757422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2990  hypothetical protein  37.8 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2652  hypothetical protein  37.85 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00434013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3756  hypothetical protein  36.4 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1254  hypothetical protein  36.92 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  unclonable  0.0000112566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1824  hypothetical protein  37.56 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2464  hypothetical protein  37.27 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.00000305564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2534  hypothetical protein  37.27 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000115095  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1662  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000135099  normal  0.141207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1640  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2718  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  hitchhiker  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1625  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00789823  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2626  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1517  hypothetical protein  34.73 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00311608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2626  hypothetical protein  36.59 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2425  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000158594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2478  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0204339  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3079  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000072399  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1154  hypothetical protein  36.44 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0111  hypothetical protein  34.02 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06760  hypothetical protein  32.66 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000848  TonB system biopolymer transport component  35.25 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1615  hypothetical protein  35.75 
 
 		 278 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0905  hypothetical protein  32.26 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2152  hypothetical protein  32.88 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.48065  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0868  hypothetical protein  31.86 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0435  hypothetical protein  41.91 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.34 
 
 		 576 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3525  hypothetical protein  27.87 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0452  hypothetical protein  28.96 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0923932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0849  hypothetical protein  25.1 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02814  TonB system biopolymer transport component  35.96 
 
 		 118 aa  70.5  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000400014  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1653  hypothetical protein  21.84 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.86808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>