41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3872 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3872  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0606  hypothetical protein  44.08 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00011128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03435  TonB system biopolymer transport component  39.09 
 
 		 252 aa  195  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1060  hypothetical protein  39.38 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00637  hypothetical protein  34.68 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1254  hypothetical protein  41.98 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  unclonable  0.0000112566 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1625  hypothetical protein  41.67 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00789823  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2718  hypothetical protein  41.67 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  hitchhiker  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1662  hypothetical protein  41.27 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000135099  normal  0.141207 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1517  hypothetical protein  41.27 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00311608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1640  hypothetical protein  41.27 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001856  TonB system biopolymer transport component  35.92 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2626  hypothetical protein  40.87 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2464  hypothetical protein  41.27 
 
 		 260 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.00000305564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2534  hypothetical protein  41.27 
 
 		 260 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000115095  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2652  hypothetical protein  41.04 
 
 		 260 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00434013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1571  hypothetical protein  39.84 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00119442  hitchhiker  0.0000757422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1824  hypothetical protein  42.41 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2478  hypothetical protein  39.84 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0204339  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3976  hypothetical protein  33.07 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2626  hypothetical protein  39.44 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0352  TonB system biopolymer transport component  37.21 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.168903  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2990  hypothetical protein  34.57 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2425  hypothetical protein  38.65 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000158594  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3756  hypothetical protein  32.28 
 
 		 259 aa  154  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3079  hypothetical protein  39.04 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000072399  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0111  hypothetical protein  33.88 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1615  hypothetical protein  37.32 
 
 		 278 aa  131  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1154  hypothetical protein  35.89 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0905  hypothetical protein  33.82 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06760  hypothetical protein  33.65 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000848  TonB system biopolymer transport component  36.28 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2152  hypothetical protein  38.86 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.48065  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0868  hypothetical protein  30.4 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0435  hypothetical protein  44.54 
 
 		 223 aa  92.4  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.62 
 
 		 576 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1653  hypothetical protein  30.18 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.86808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02814  TonB system biopolymer transport component  35.34 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000400014  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3525  hypothetical protein  29.17 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0452  hypothetical protein  32.88 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0923932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0849  hypothetical protein  26.1 
 
 		 272 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>