41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2718 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2718  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  hitchhiker  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1625  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00789823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1640  hypothetical protein  99.62 
 
 
260 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1662  hypothetical protein  99.62 
 
 
260 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000135099  normal  0.141207 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2626  hypothetical protein  97.31 
 
 
260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1517  hypothetical protein  96.92 
 
 
260 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00311608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2464  hypothetical protein  95.77 
 
 
260 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.00000305564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2534  hypothetical protein  95.77 
 
 
260 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000115095  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1254  hypothetical protein  87.69 
 
 
260 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  unclonable  0.0000112566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2425  hypothetical protein  83.46 
 
 
260 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000158594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1571  hypothetical protein  82.31 
 
 
260 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00119442  hitchhiker  0.0000757422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2652  hypothetical protein  81.54 
 
 
260 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00434013  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1824  hypothetical protein  93.21 
 
 
221 aa  427  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2626  hypothetical protein  83.46 
 
 
260 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2478  hypothetical protein  77.31 
 
 
260 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0204339  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3079  hypothetical protein  75 
 
 
260 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000072399  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2990  hypothetical protein  48.43 
 
 
254 aa  265  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3756  hypothetical protein  45.31 
 
 
259 aa  248  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0606  hypothetical protein  35.46 
 
 
257 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00011128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3872  hypothetical protein  42.86 
 
 
257 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00637  hypothetical protein  36.69 
 
 
254 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1060  hypothetical protein  36.36 
 
 
256 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14975  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001856  TonB system biopolymer transport component  34.96 
 
 
254 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03435  TonB system biopolymer transport component  34.26 
 
 
252 aa  158  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3976  hypothetical protein  34.11 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0352  TonB system biopolymer transport component  35.48 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.168903  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1154  hypothetical protein  34.84 
 
 
252 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0905  hypothetical protein  32.35 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0111  hypothetical protein  33.87 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06760  hypothetical protein  34.06 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02814  TonB system biopolymer transport component  50.42 
 
 
118 aa  128  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000400014  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000848  TonB system biopolymer transport component  36.29 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0868  hypothetical protein  32.03 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2152  hypothetical protein  29.39 
 
 
252 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.48065  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1615  hypothetical protein  28.24 
 
 
278 aa  98.6  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0435  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0849  hypothetical protein  24.71 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.14 
 
 
576 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3525  hypothetical protein  30.46 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0452  hypothetical protein  27.81 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0923932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1653  hypothetical protein  27.12 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.86808  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>