41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0868 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0868  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  520  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2478  hypothetical protein  33.07 
 
 
260 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0204339  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3079  hypothetical protein  32.27 
 
 
260 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000072399  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1571  hypothetical protein  31.47 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00119442  hitchhiker  0.0000757422 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0606  hypothetical protein  32.42 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00011128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001856  TonB system biopolymer transport component  30.61 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00637  hypothetical protein  29.88 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3976  hypothetical protein  30.2 
 
 
273 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2652  hypothetical protein  32.58 
 
 
260 aa  125  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00434013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1060  hypothetical protein  32.02 
 
 
256 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2626  hypothetical protein  31.63 
 
 
260 aa  125  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2990  hypothetical protein  26.77 
 
 
254 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1254  hypothetical protein  31.08 
 
 
260 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  unclonable  0.0000112566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2425  hypothetical protein  30.28 
 
 
260 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000158594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1824  hypothetical protein  31.67 
 
 
221 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2464  hypothetical protein  31.17 
 
 
260 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.00000305564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2534  hypothetical protein  31.17 
 
 
260 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000115095  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2626  hypothetical protein  31.6 
 
 
260 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1640  hypothetical protein  32.03 
 
 
260 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1662  hypothetical protein  32.03 
 
 
260 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000135099  normal  0.141207 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2718  hypothetical protein  32.03 
 
 
260 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  hitchhiker  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1625  hypothetical protein  32.03 
 
 
260 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00789823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1517  hypothetical protein  30.74 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00311608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0352  TonB system biopolymer transport component  32.56 
 
 
260 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.168903  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3756  hypothetical protein  28.81 
 
 
259 aa  118  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03435  TonB system biopolymer transport component  30.89 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1154  hypothetical protein  28.69 
 
 
252 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3872  hypothetical protein  31.02 
 
 
257 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0905  hypothetical protein  27.8 
 
 
255 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0111  hypothetical protein  27.73 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06760  hypothetical protein  27.98 
 
 
255 aa  89.7  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3525  hypothetical protein  30.73 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000848  TonB system biopolymer transport component  25 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1615  hypothetical protein  27.91 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2152  hypothetical protein  25.7 
 
 
252 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.48065  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0452  hypothetical protein  26.19 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0923932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0849  hypothetical protein  27.43 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1653  hypothetical protein  26.5 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.86808  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.62 
 
 
576 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02814  TonB system biopolymer transport component  27.83 
 
 
118 aa  49.3  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000400014  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0435  hypothetical protein  29.81 
 
 
223 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>