33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02814 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02814  TonB system biopolymer transport component  100 
 
 		 118 aa  239  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000400014  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2990  hypothetical protein  75.63 
 
 		 254 aa  184  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3756  hypothetical protein  57.98 
 
 		 259 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2652  hypothetical protein  52.1 
 
 		 260 aa  130  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00434013  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1254  hypothetical protein  50.42 
 
 		 260 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  unclonable  0.0000112566 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1625  hypothetical protein  50.42 
 
 		 260 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00789823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1571  hypothetical protein  50.42 
 
 		 260 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00119442  hitchhiker  0.0000757422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1640  hypothetical protein  50.42 
 
 		 260 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1662  hypothetical protein  50.42 
 
 		 260 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000135099  normal  0.141207 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2534  hypothetical protein  49.58 
 
 		 260 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000115095  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2464  hypothetical protein  49.58 
 
 		 260 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.00000305564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2718  hypothetical protein  50.42 
 
 		 260 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  hitchhiker  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2626  hypothetical protein  49.58 
 
 		 260 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1517  hypothetical protein  49.58 
 
 		 260 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00311608  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2425  hypothetical protein  48.74 
 
 		 260 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000158594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2478  hypothetical protein  48.74 
 
 		 260 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0204339  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3079  hypothetical protein  47.9 
 
 		 260 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000072399  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2626  hypothetical protein  49.58 
 
 		 260 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1824  hypothetical protein  52.69 
 
 		 221 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000848  TonB system biopolymer transport component  41.9 
 
 		 252 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1154  hypothetical protein  46.07 
 
 		 252 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06760  hypothetical protein  41.12 
 
 		 255 aa  83.6  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0606  hypothetical protein  41.88 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00011128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00637  hypothetical protein  35.09 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03435  TonB system biopolymer transport component  38.46 
 
 		 252 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0905  hypothetical protein  37.96 
 
 		 255 aa  77.4  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001856  TonB system biopolymer transport component  34.21 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0111  hypothetical protein  36.52 
 
 		 255 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3872  hypothetical protein  38.54 
 
 		 257 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1060  hypothetical protein  37.27 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0352  TonB system biopolymer transport component  32.48 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.168903  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3976  hypothetical protein  32.76 
 
 		 273 aa  63.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0868  hypothetical protein  28.09 
 
 		 260 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>