41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2990 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2990  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3756  hypothetical protein  54.94 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1517  hypothetical protein  48.82 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00311608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2718  hypothetical protein  48.43 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  hitchhiker  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1625  hypothetical protein  48.43 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00789823  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2534  hypothetical protein  48.43 
 
 		 260 aa  264  8e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000115095  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2464  hypothetical protein  48.43 
 
 		 260 aa  264  8e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.00000305564 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1662  hypothetical protein  48.43 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000135099  normal  0.141207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1640  hypothetical protein  48.43 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2626  hypothetical protein  48.03 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2478  hypothetical protein  48.43 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0204339  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1254  hypothetical protein  46.46 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  unclonable  0.0000112566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2626  hypothetical protein  48.43 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2652  hypothetical protein  47.24 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00434013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2425  hypothetical protein  47.64 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000158594  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3079  hypothetical protein  47.64 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000072399  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1571  hypothetical protein  46.06 
 
 		 260 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00119442  hitchhiker  0.0000757422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1824  hypothetical protein  47.47 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0606  hypothetical protein  39.36 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00011128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02814  TonB system biopolymer transport component  75.63 
 
 		 118 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000400014  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00637  hypothetical protein  37.01 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03435  TonB system biopolymer transport component  39.75 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001856  TonB system biopolymer transport component  37.4 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0352  TonB system biopolymer transport component  38.31 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.168903  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1060  hypothetical protein  39.53 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14975  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06760  hypothetical protein  37.1 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1154  hypothetical protein  38.1 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0905  hypothetical protein  34.89 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3976  hypothetical protein  33.86 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3872  hypothetical protein  35.16 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0111  hypothetical protein  34.69 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000848  TonB system biopolymer transport component  37.4 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0868  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2152  hypothetical protein  29.07 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.48065  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1615  hypothetical protein  30.14 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0435  hypothetical protein  33.83 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0849  hypothetical protein  24.66 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.27 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3525  hypothetical protein  27.62 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0452  hypothetical protein  26.38 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0923932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1653  hypothetical protein  22.81 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.86808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>