41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0352 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0352  TonB system biopolymer transport component  100 
 
 		 260 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.168903  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03435  TonB system biopolymer transport component  46.34 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1060  hypothetical protein  47.14 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3976  hypothetical protein  40.47 
 
 		 273 aa  184  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0606  hypothetical protein  38.4 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00011128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2990  hypothetical protein  38.31 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00637  hypothetical protein  34.62 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001856  TonB system biopolymer transport component  34.55 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3756  hypothetical protein  34.8 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1571  hypothetical protein  34.13 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00119442  hitchhiker  0.0000757422 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3079  hypothetical protein  35.71 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000072399  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3872  hypothetical protein  37.21 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2626  hypothetical protein  35.32 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2478  hypothetical protein  35.32 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0204339  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1254  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  unclonable  0.0000112566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2464  hypothetical protein  35.94 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.00000305564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2534  hypothetical protein  35.94 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000115095  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1517  hypothetical protein  34.62 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00311608  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2626  hypothetical protein  35.48 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1662  hypothetical protein  35.48 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000135099  normal  0.141207 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2718  hypothetical protein  35.48 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  hitchhiker  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1625  hypothetical protein  35.48 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00789823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1640  hypothetical protein  35.48 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2425  hypothetical protein  33.73 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000158594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2652  hypothetical protein  34.7 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00434013  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1824  hypothetical protein  35.48 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06760  hypothetical protein  33.65 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0905  hypothetical protein  30.31 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0111  hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1154  hypothetical protein  32.39 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0868  hypothetical protein  31.38 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000848  TonB system biopolymer transport component  32.78 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2152  hypothetical protein  31.07 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.48065  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1615  hypothetical protein  30.24 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0435  hypothetical protein  39.34 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.88 
 
 		 576 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1653  hypothetical protein  24.22 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.86808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3525  hypothetical protein  28.98 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0849  hypothetical protein  26.72 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02814  TonB system biopolymer transport component  32.48 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000400014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0452  hypothetical protein  24.41 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0923932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>