41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1824 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1824  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2626  hypothetical protein  95.02 
 
 		 260 aa  434  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2534  hypothetical protein  95.48 
 
 		 260 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000115095  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2464  hypothetical protein  95.48 
 
 		 260 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.00000305564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2718  hypothetical protein  93.21 
 
 		 260 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  hitchhiker  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1640  hypothetical protein  93.21 
 
 		 260 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00662139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1625  hypothetical protein  93.21 
 
 		 260 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00789823  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1662  hypothetical protein  93.21 
 
 		 260 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000135099  normal  0.141207 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1517  hypothetical protein  93.21 
 
 		 260 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00311608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1254  hypothetical protein  85.91 
 
 		 260 aa  393  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0973125  unclonable  0.0000112566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1571  hypothetical protein  80 
 
 		 260 aa  367  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00119442  hitchhiker  0.0000757422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2652  hypothetical protein  80.91 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00434013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2425  hypothetical protein  79.55 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000158594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2626  hypothetical protein  83.02 
 
 		 260 aa  362  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2478  hypothetical protein  75.45 
 
 		 260 aa  348  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0204339  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3079  hypothetical protein  72.27 
 
 		 260 aa  332  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000072399  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2990  hypothetical protein  47.47 
 
 		 254 aa  223  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3756  hypothetical protein  42.13 
 
 		 259 aa  201  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001856  TonB system biopolymer transport component  39.34 
 
 		 254 aa  167  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3872  hypothetical protein  42.41 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00637  hypothetical protein  38.43 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0606  hypothetical protein  37.56 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00011128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1060  hypothetical protein  37.56 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03435  TonB system biopolymer transport component  37.56 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0352  TonB system biopolymer transport component  35.48 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.168903  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3976  hypothetical protein  34.98 
 
 		 273 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0111  hypothetical protein  37.09 
 
 		 255 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1154  hypothetical protein  36.22 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0905  hypothetical protein  33.81 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06760  hypothetical protein  34.29 
 
 		 255 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0868  hypothetical protein  31.67 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000848  TonB system biopolymer transport component  35.71 
 
 		 252 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02814  TonB system biopolymer transport component  52.69 
 
 		 118 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000400014  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1615  hypothetical protein  30.92 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2152  hypothetical protein  29.58 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.48065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0435  hypothetical protein  31.79 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0849  hypothetical protein  24.66 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.81 
 
 		 576 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3525  hypothetical protein  31.13 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0452  hypothetical protein  32.37 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0923932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1653  hypothetical protein  25.42 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.86808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>