16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2542 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2542  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  310  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16342  normal  0.73231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2056  hypothetical protein  59.46 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2056  hypothetical protein  56.38 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.692686  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0095  hypothetical protein  39.1 
 
 		 163 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0104  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0258  hypothetical protein  37.09 
 
 		 231 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000038516  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  38.52 
 
 		 1019 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  38.52 
 
 		 1019 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3609  hypothetical protein  37.75 
 
 		 196 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  34.07 
 
 		 1114 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1111 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  31.06 
 
 		 1111 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  31.06 
 
 		 1111 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  30.3 
 
 		 1111 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3137  hypothetical protein  29.01 
 
 		 192 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.179109  normal  0.521245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1921  hypothetical protein  27.04 
 
 		 228 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>