15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3137 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3137  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.179109  normal  0.521245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  30.41 
 
 
1019 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0258  hypothetical protein  31.76 
 
 
231 aa  58.9  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000038516  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  29.73 
 
 
1019 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0095  hypothetical protein  34.31 
 
 
163 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  27.86 
 
 
1111 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  27.86 
 
 
1111 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  27.86 
 
 
1111 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0104  hypothetical protein  32.12 
 
 
165 aa  51.6  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  27.14 
 
 
1111 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3609  hypothetical protein  27.33 
 
 
196 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2056  hypothetical protein  30.53 
 
 
158 aa  48.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.692686  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2542  hypothetical protein  29.01 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16342  normal  0.73231 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  29.08 
 
 
1114 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2056  hypothetical protein  27.46 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>