16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0104 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0104  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  342  8.999999999999999e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0095  hypothetical protein  80.61 
 
 
163 aa  280  5.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0258  hypothetical protein  63.82 
 
 
231 aa  210  7.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000038516  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  39.04 
 
 
1111 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  41.91 
 
 
1019 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  41.91 
 
 
1019 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  37.67 
 
 
1111 aa  97.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  37.67 
 
 
1111 aa  97.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  37.67 
 
 
1111 aa  97.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2056  hypothetical protein  40.74 
 
 
158 aa  94  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.692686  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2542  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16342  normal  0.73231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3609  hypothetical protein  36.23 
 
 
196 aa  84  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2056  hypothetical protein  38.93 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  36.99 
 
 
1114 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1921  hypothetical protein  28.05 
 
 
228 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642043  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3137  hypothetical protein  32.12 
 
 
192 aa  51.6  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.179109  normal  0.521245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>