14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1921 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1921  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642043  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1844  hypothetical protein  45.22 
 
 
256 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.103279  normal  0.948027 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0258  hypothetical protein  28.05 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000038516  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  23.63 
 
 
1111 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  24.16 
 
 
1111 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0104  hypothetical protein  28.05 
 
 
165 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  23.63 
 
 
1111 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  23.63 
 
 
1111 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  27.75 
 
 
1019 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2056  hypothetical protein  29.94 
 
 
174 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2056  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  48.9  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.692686  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  26.95 
 
 
1019 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  30.11 
 
 
1114 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0095  hypothetical protein  32.53 
 
 
163 aa  43.5  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>