15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3609 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3609  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  55.47 
 
 		 1019 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  55.47 
 
 		 1019 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  42.65 
 
 		 1111 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  42.65 
 
 		 1111 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  42.65 
 
 		 1111 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  42.65 
 
 		 1111 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2056  hypothetical protein  42.65 
 
 		 158 aa  99.4  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.692686  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  42.14 
 
 		 1114 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2056  hypothetical protein  40.43 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0258  hypothetical protein  35.07 
 
 		 231 aa  89  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000038516  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2542  hypothetical protein  37.75 
 
 		 151 aa  84.7  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16342  normal  0.73231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0104  hypothetical protein  36.23 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0095  hypothetical protein  35.04 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3137  hypothetical protein  27.33 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.179109  normal  0.521245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>