30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37560 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  39.53 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  37.91 
 
 		 160 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  36.31 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  33.54 
 
 		 181 aa  91.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2143  hypothetical protein  45.3 
 
 		 174 aa  90.9  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5722  hypothetical protein  39.72 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5085  hypothetical protein  44.25 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2029  hypothetical protein  32.72 
 
 		 161 aa  84  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.012492  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  37.41 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  42.5 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  37.41 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  37.41 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  37.09 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0125  hypothetical protein  37.29 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.633803  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  37.7 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0979  hypothetical protein  32.16 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254072  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6789  hypothetical protein  38.18 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4824  hypothetical protein  40.66 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0041  hypothetical protein  40.22 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3136  hypothetical protein  52.7 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206049  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2935  hypothetical protein  40.91 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00754461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1875  hypothetical protein  35.56 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.919221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1707  hypothetical protein  29.5 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.226916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  29.58 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3482  hypothetical protein  28.83 
 
 		 322 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0437118  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5797  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2214  hypothetical protein  27.97 
 
 		 307 aa  52  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.133003  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3611  hypothetical protein  35.38 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1899  hypothetical protein  36.3 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.701457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>