30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2518 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  321  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  321  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  321  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  62.33 
 
 
171 aa  175  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  50.61 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5085  hypothetical protein  54.92 
 
 
179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  51.33 
 
 
160 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2143  hypothetical protein  49.62 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  42.33 
 
 
170 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0979  hypothetical protein  45.14 
 
 
172 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254072  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0125  hypothetical protein  45.83 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.633803  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  41.77 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  41.56 
 
 
160 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3611  hypothetical protein  48.84 
 
 
169 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6789  hypothetical protein  57.14 
 
 
170 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0041  hypothetical protein  49.01 
 
 
159 aa  102  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5797  hypothetical protein  54.47 
 
 
133 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2029  hypothetical protein  39.29 
 
 
161 aa  90.9  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.012492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  35.1 
 
 
181 aa  87.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5722  hypothetical protein  43.66 
 
 
165 aa  87  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1899  hypothetical protein  50.35 
 
 
174 aa  87  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.701457  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  37.41 
 
 
176 aa  85.1  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4824  hypothetical protein  41.25 
 
 
165 aa  84.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3136  hypothetical protein  46.91 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206049  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1707  hypothetical protein  31.62 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.226916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2935  hypothetical protein  38.54 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00754461  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2214  hypothetical protein  27.11 
 
 
307 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.133003  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  26.99 
 
 
317 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3482  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0437118  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1875  hypothetical protein  34.75 
 
 
166 aa  43.9  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.919221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>