26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1707 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1707  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  322  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.226916 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1875  hypothetical protein  56.02 
 
 
166 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.919221  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  31.21 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2029  hypothetical protein  31.21 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.012492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  31.14 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  28.67 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5722  hypothetical protein  34.88 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  29.5 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  26.71 
 
 
317 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  32.31 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0041  hypothetical protein  30.61 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  32.31 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  32.31 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3482  hypothetical protein  29.91 
 
 
322 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0437118  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5085  hypothetical protein  31.82 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  27.34 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0979  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254072  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  27.56 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2143  hypothetical protein  30.43 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0125  hypothetical protein  29.47 
 
 
163 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.633803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6789  hypothetical protein  32.5 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  37.31 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3611  hypothetical protein  39.62 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2214  hypothetical protein  22.15 
 
 
307 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.133003  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5797  hypothetical protein  35.09 
 
 
133 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>