30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1021 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  330  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  57.42 
 
 
171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  50.61 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  50.61 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  50.61 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5085  hypothetical protein  59.5 
 
 
179 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2143  hypothetical protein  50.39 
 
 
174 aa  121  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  41.18 
 
 
170 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0041  hypothetical protein  47.37 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  45.67 
 
 
160 aa  110  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0979  hypothetical protein  47.18 
 
 
172 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254072  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  39.86 
 
 
160 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  38.46 
 
 
171 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0125  hypothetical protein  42.02 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.633803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6789  hypothetical protein  44.16 
 
 
170 aa  97.4  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5797  hypothetical protein  48.85 
 
 
133 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  37.09 
 
 
176 aa  91.7  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4824  hypothetical protein  41.46 
 
 
165 aa  91.3  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3611  hypothetical protein  44.44 
 
 
169 aa  89  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2029  hypothetical protein  36.81 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.012492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  36.49 
 
 
181 aa  88.6  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1899  hypothetical protein  46.75 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.701457  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5722  hypothetical protein  39.61 
 
 
165 aa  84  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3136  hypothetical protein  48.84 
 
 
156 aa  61.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206049  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2935  hypothetical protein  41.24 
 
 
156 aa  60.8  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00754461  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1875  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.919221  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1707  hypothetical protein  29.56 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.226916 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2214  hypothetical protein  30.71 
 
 
307 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.133003  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  32.1 
 
 
317 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3482  hypothetical protein  33.77 
 
 
322 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0437118  normal  0.56457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>