19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3482 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3482  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0437118  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  79.6 
 
 
317 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2214  hypothetical protein  45.28 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.133003  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0007  hypothetical protein  44.17 
 
 
132 aa  85.9  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.042136  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1707  hypothetical protein  25.34 
 
 
161 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.226916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  27.33 
 
 
176 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  31.85 
 
 
160 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  29.56 
 
 
181 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  27.85 
 
 
171 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1875  hypothetical protein  32.73 
 
 
166 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.919221  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  27.1 
 
 
171 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  31.87 
 
 
160 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0041  hypothetical protein  34.31 
 
 
159 aa  46.6  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  28.48 
 
 
168 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5085  hypothetical protein  33.85 
 
 
179 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  27.78 
 
 
170 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>