30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3842 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  310  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  52.83 
 
 		 170 aa  160  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  50.32 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0979  hypothetical protein  52.29 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254072  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5085  hypothetical protein  57.02 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  51.33 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  51.33 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  51.33 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2143  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0125  hypothetical protein  52.89 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.633803  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0041  hypothetical protein  52.32 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1899  hypothetical protein  60.54 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.701457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6789  hypothetical protein  57.5 
 
 		 170 aa  120  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  39.35 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  43.66 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3611  hypothetical protein  51.61 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  39.86 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  38.51 
 
 		 176 aa  90.9  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2029  hypothetical protein  35.57 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.012492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5722  hypothetical protein  39.86 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4824  hypothetical protein  41.89 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5797  hypothetical protein  45.67 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  30 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3136  hypothetical protein  47.67 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206049  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2214  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  62  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.133003  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1707  hypothetical protein  26.8 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.226916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  30.2 
 
 		 317 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2935  hypothetical protein  41.67 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00754461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1875  hypothetical protein  31.15 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.919221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3482  hypothetical protein  31.87 
 
 		 322 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0437118  normal  0.56457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>