19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2214 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2214  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  595  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.133003  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  47.67 
 
 
317 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3482  hypothetical protein  45 
 
 
322 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0437118  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0007  hypothetical protein  41.18 
 
 
132 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.042136  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  27.71 
 
 
160 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  26.51 
 
 
163 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  26.51 
 
 
163 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  26.51 
 
 
163 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  27.4 
 
 
160 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  26.95 
 
 
176 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5722  hypothetical protein  29.8 
 
 
165 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  26.58 
 
 
170 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  29.56 
 
 
181 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2029  hypothetical protein  25.77 
 
 
161 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.012492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  30.71 
 
 
171 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  23.53 
 
 
171 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2143  hypothetical protein  31.91 
 
 
174 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  30.71 
 
 
168 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4824  hypothetical protein  32.04 
 
 
165 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>