30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2143 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2143  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  343  8.999999999999999e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6789  hypothetical protein  63.35 
 
 		 170 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  46.58 
 
 		 171 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5085  hypothetical protein  59.06 
 
 		 179 aa  141  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  45.39 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  47.3 
 
 		 163 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0979  hypothetical protein  50 
 
 		 172 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254072  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  47.3 
 
 		 163 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  47.3 
 
 		 163 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0125  hypothetical protein  48.36 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.633803  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  44.59 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  46.9 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  40.13 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0041  hypothetical protein  51.72 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  40.28 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1899  hypothetical protein  49.31 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.701457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2029  hypothetical protein  38.31 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.012492  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3611  hypothetical protein  44.27 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5797  hypothetical protein  52.08 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5722  hypothetical protein  39.86 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  33.77 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4824  hypothetical protein  47.56 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3136  hypothetical protein  49.45 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206049  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2935  hypothetical protein  40.91 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00754461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  31.79 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1707  hypothetical protein  29.69 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.226916 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1875  hypothetical protein  31.11 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.919221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2214  hypothetical protein  29.41 
 
 		 307 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.133003  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3482  hypothetical protein  29.51 
 
 		 322 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0437118  normal  0.56457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>