31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3640 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  339  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2029  hypothetical protein  44.1 
 
 
161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.012492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5722  hypothetical protein  51.41 
 
 
165 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2143  hypothetical protein  45.83 
 
 
174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  39.53 
 
 
176 aa  114  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  41.03 
 
 
181 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  40 
 
 
171 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5085  hypothetical protein  46.43 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  40.99 
 
 
163 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  40.99 
 
 
163 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  40.99 
 
 
163 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  42.66 
 
 
160 aa  98.2  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  38.46 
 
 
168 aa  90.9  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0979  hypothetical protein  45.71 
 
 
172 aa  88.2  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254072  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  39.55 
 
 
160 aa  87.4  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6789  hypothetical protein  47.87 
 
 
170 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0041  hypothetical protein  47.42 
 
 
159 aa  84  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0125  hypothetical protein  40.35 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.633803  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4824  hypothetical protein  47.31 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1707  hypothetical protein  31.21 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.226916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3611  hypothetical protein  37.88 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1875  hypothetical protein  35.78 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.919221  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5797  hypothetical protein  38.54 
 
 
133 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3136  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206049  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2935  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00754461  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1899  hypothetical protein  39.29 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.701457  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  28.95 
 
 
317 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2214  hypothetical protein  30.71 
 
 
307 aa  48.5  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.133003  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3482  hypothetical protein  30.77 
 
 
322 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0437118  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0007  hypothetical protein  25.98 
 
 
132 aa  41.2  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.042136  normal  0.325201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>