29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3611 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3611  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  337  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  50.32 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0125  hypothetical protein  54.7 
 
 
163 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.633803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  49.04 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  43.79 
 
 
171 aa  127  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0041  hypothetical protein  59.79 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5085  hypothetical protein  45 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  45.51 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  45.51 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  45.51 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2143  hypothetical protein  44.27 
 
 
174 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1899  hypothetical protein  55.48 
 
 
174 aa  104  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.701457  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6789  hypothetical protein  51.28 
 
 
170 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  41.03 
 
 
168 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0979  hypothetical protein  40.79 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254072  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  35.95 
 
 
171 aa  91.3  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  36.67 
 
 
160 aa  88.6  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2029  hypothetical protein  32.92 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.012492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  32.9 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5722  hypothetical protein  36.36 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  34.03 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5797  hypothetical protein  45.16 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4824  hypothetical protein  46.24 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1707  hypothetical protein  31.13 
 
 
161 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.226916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3136  hypothetical protein  41.98 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206049  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  37.36 
 
 
317 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2935  hypothetical protein  42.47 
 
 
156 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00754461  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3482  hypothetical protein  37.84 
 
 
322 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0437118  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1875  hypothetical protein  36.73 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.919221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>