24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3709 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3482  hypothetical protein  79.6 
 
 
322 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0437118  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2214  hypothetical protein  47.56 
 
 
307 aa  228  9e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.133003  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0007  hypothetical protein  46.61 
 
 
132 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.042136  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  30.52 
 
 
176 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1875  hypothetical protein  35.71 
 
 
166 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.919221  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1707  hypothetical protein  26.71 
 
 
161 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.226916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  27.04 
 
 
171 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  30.37 
 
 
160 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  25.33 
 
 
160 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  26.38 
 
 
171 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  28.66 
 
 
181 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0041  hypothetical protein  36.96 
 
 
159 aa  49.7  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2143  hypothetical protein  30.83 
 
 
174 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  29.22 
 
 
170 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5722  hypothetical protein  28.32 
 
 
165 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  27.22 
 
 
163 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  27.22 
 
 
163 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  27.22 
 
 
163 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  28.75 
 
 
168 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0125  hypothetical protein  32.53 
 
 
163 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.633803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5085  hypothetical protein  33.67 
 
 
179 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0979  hypothetical protein  28.85 
 
 
172 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254072  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3611  hypothetical protein  37.36 
 
 
169 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>