30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5085 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5085  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  346  9e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  50.6 
 
 
171 aa  156  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2143  hypothetical protein  56.49 
 
 
174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  47.06 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  57.36 
 
 
160 aa  144  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  51.3 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  51.3 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  51.3 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  54.19 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0041  hypothetical protein  57.52 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  43.68 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  42.95 
 
 
160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0125  hypothetical protein  48.33 
 
 
163 aa  124  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.633803  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0979  hypothetical protein  50.7 
 
 
172 aa  124  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254072  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1899  hypothetical protein  57.14 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.701457  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6789  hypothetical protein  50.31 
 
 
170 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5722  hypothetical protein  47.92 
 
 
165 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3611  hypothetical protein  45 
 
 
169 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2029  hypothetical protein  38.82 
 
 
161 aa  98.2  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.012492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  38.78 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5797  hypothetical protein  47.62 
 
 
133 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  33.13 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4824  hypothetical protein  46.91 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1707  hypothetical protein  31.88 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.226916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3136  hypothetical protein  48.05 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206049  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2935  hypothetical protein  44.59 
 
 
156 aa  58.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00754461  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  32.12 
 
 
317 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1875  hypothetical protein  32.37 
 
 
166 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.919221  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2214  hypothetical protein  26.87 
 
 
307 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.133003  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3482  hypothetical protein  33.77 
 
 
322 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0437118  normal  0.56457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>