27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1875 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1875  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  323  9e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.919221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1707  hypothetical protein  56.02 
 
 		 161 aa  175  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.226916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  35.56 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  33.1 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  32.89 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  35.77 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2029  hypothetical protein  34.03 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.012492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5722  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  34.01 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  34.75 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5085  hypothetical protein  32.73 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3482  hypothetical protein  32.73 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0437118  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  31.15 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2143  hypothetical protein  31.03 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  31.33 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  34.75 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  34.75 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  34.75 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0979  hypothetical protein  32.61 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254072  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0041  hypothetical protein  30.82 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  34.33 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6789  hypothetical protein  32.14 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2214  hypothetical protein  26.32 
 
 		 307 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.133003  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0125  hypothetical protein  32.53 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.633803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5797  hypothetical protein  35.09 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0007  hypothetical protein  31.4 
 
 		 132 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.042136  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3136  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206049  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>