28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2935 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2935  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  304  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00754461  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3136  hypothetical protein  83.97 
 
 
156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206049  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3640  hypothetical protein  38.61 
 
 
171 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2518  hypothetical protein  38.26 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.356571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2555  hypothetical protein  38.26 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135357  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2563  hypothetical protein  38.26 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3664  hypothetical protein  35 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4754  hypothetical protein  36.62 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4824  hypothetical protein  55 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2143  hypothetical protein  39.53 
 
 
174 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37560  hypothetical protein  36.15 
 
 
176 aa  83.6  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177686  normal  0.426382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5085  hypothetical protein  40.54 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2029  hypothetical protein  39.13 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.012492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7898  hypothetical protein  34.27 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0041  hypothetical protein  41.72 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1021  hypothetical protein  36.31 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0242  hypothetical protein  34.93 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0979  hypothetical protein  40.43 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254072  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3842  hypothetical protein  42.02 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6789  hypothetical protein  44.94 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5722  hypothetical protein  36.17 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1899  hypothetical protein  39.26 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.701457  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0125  hypothetical protein  35.44 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.633803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3611  hypothetical protein  34.75 
 
 
169 aa  60.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5797  hypothetical protein  39.29 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2214  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.133003  normal  0.312145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3709  hypothetical protein  25.56 
 
 
317 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1875  hypothetical protein  28.28 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.919221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>