33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  55.78 
 
 
298 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  47.83 
 
 
314 aa  248  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0165  aminoglycoside phosphotransferase  47.87 
 
 
313 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0157854  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  38.59 
 
 
310 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  39.58 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  37.24 
 
 
303 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  39.93 
 
 
302 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  36.61 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  39.57 
 
 
303 aa  149  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1225  aminoglycoside phosphotransferase  33.78 
 
 
302 aa  149  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  35.91 
 
 
256 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  32.1 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  33.45 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  32.21 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  35.29 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  29.77 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  30.69 
 
 
285 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  34.11 
 
 
305 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  27.08 
 
 
316 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3843  aminoglycoside phosphotransferase  28.26 
 
 
353 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  30.36 
 
 
318 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  26.95 
 
 
316 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2979  aminoglycoside phosphotransferase  29.13 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0251583  normal  0.510052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  40.68 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2431  hypothetical protein  32.33 
 
 
434 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  25.49 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 
243 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3141  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
355 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.165863  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2648  aminoglycoside phosphotransferase  43.33 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.691682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1699  aminoglycoside phosphotransferase  27.18 
 
 
312 aa  42.4  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  hitchhiker  0.00000021622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>