40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7275 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  39.58 
 
 
295 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  43.36 
 
 
298 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  39.86 
 
 
314 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  39.39 
 
 
303 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  41.24 
 
 
302 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0165  aminoglycoside phosphotransferase  37.01 
 
 
313 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0157854  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  36 
 
 
301 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  35.54 
 
 
310 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  35.99 
 
 
304 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1225  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 
256 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
303 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  31.09 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  32.47 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  30.34 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  29.13 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  33.18 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0109  hypothetical protein  26.28 
 
 
323 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.321439  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1577  hypothetical protein  26.35 
 
 
326 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 
324 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  32.26 
 
 
273 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  32.12 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  32.09 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  24.73 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  27.91 
 
 
288 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2109  aminoglycoside phosphotransferase  24.61 
 
 
306 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  28.37 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1721  aminoglycoside phosphotransferase  30.9 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.496446  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  30.3 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0268  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  26.83 
 
 
313 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 
324 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  25.61 
 
 
329 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3563  aminoglycoside phosphotransferase  48.84 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1872  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  21.46 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1993  serine/threonine protein kinase  38.75 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>