26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4410 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
314 aa  614  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0165  aminoglycoside phosphotransferase  65.79 
 
 
313 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0157854  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  51.17 
 
 
298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  48.01 
 
 
295 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
310 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  39.86 
 
 
298 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  34.11 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  36.6 
 
 
256 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  33.21 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1225  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  31.42 
 
 
301 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  32.41 
 
 
303 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  29.33 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0064  hypothetical protein  23.48 
 
 
303 aa  52.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  30.17 
 
 
318 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  29.82 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1726  aminoglycoside phosphotransferase  32.61 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000439943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  34.56 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  29.79 
 
 
306 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  28.46 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  29.92 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4899  aminoglycoside phosphotransferase  29.71 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  26.54 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  38.18 
 
 
305 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3843  aminoglycoside phosphotransferase  28.24 
 
 
353 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>