20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0165 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0165  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
313 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0157854  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  65.79 
 
 
314 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  49.51 
 
 
295 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  50.98 
 
 
298 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  42.11 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  37.66 
 
 
298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  36.08 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  34.78 
 
 
302 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1225  aminoglycoside phosphotransferase  32.59 
 
 
302 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  35.77 
 
 
256 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  36.27 
 
 
303 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  32.39 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  29.19 
 
 
301 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1726  aminoglycoside phosphotransferase  29.9 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000439943  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4899  aminoglycoside phosphotransferase  34.45 
 
 
302 aa  49.7  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  29.19 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1987  hypothetical protein  31.52 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.908113  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  35.66 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  29.06 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0064  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>