29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1106 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 303 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1225  aminoglycoside phosphotransferase  41.72 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  37.54 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.24 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  35.25 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  34.11 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  33.45 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0165  aminoglycoside phosphotransferase  35.4 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0157854  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  33.8 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  29.87 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  34.16 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  29.18 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  32 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  28.08 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  24.49 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 		 340 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  28.37 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1516  aminoglycoside phosphotransferase  25.96 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.319617  hitchhiker  0.0000160079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0396  aminoglycoside phosphotransferase  26.92 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.719796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  28.65 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2295  serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1772  aminoglycoside phosphotransferase  29.13 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0604  aminoglycoside phosphotransferase  25.96 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.188833  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1778  aminoglycoside phosphotransferase  25.96 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.433821  hitchhiker  0.000309489 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 341 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1570  hypothetical protein  25.61 
 
 		 263 aa  42.4  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00112877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>