28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2376 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  616  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  39.44 
 
 
256 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  35.82 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1225  aminoglycoside phosphotransferase  35.17 
 
 
302 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 
303 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.61 
 
 
295 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  34.91 
 
 
302 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  35.99 
 
 
298 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  32.37 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  33.56 
 
 
301 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  33.09 
 
 
298 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0165  aminoglycoside phosphotransferase  31.19 
 
 
313 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0157854  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  30.96 
 
 
310 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  30.99 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  31.6 
 
 
288 aa  55.8  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  30.5 
 
 
273 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  26.7 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  30.49 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5100  hypothetical protein  31.96 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  25.77 
 
 
306 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  29.95 
 
 
296 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4801  hypothetical protein  31.44 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3218  hypothetical protein  28.89 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42082  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4715  hypothetical protein  31.44 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  32.84 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  36.73 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  29.66 
 
 
316 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1623  aminoglycoside phosphotransferase  31.5 
 
 
329 aa  42.4  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>