25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3449 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  39.44 
 
 
304 aa  166  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1225  aminoglycoside phosphotransferase  33.97 
 
 
302 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  35.25 
 
 
303 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  36.6 
 
 
314 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.91 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  36.02 
 
 
298 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0165  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 
313 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0157854  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  32.82 
 
 
298 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  29.62 
 
 
310 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  30.5 
 
 
301 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  35.09 
 
 
302 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 
303 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  31.79 
 
 
318 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  32.97 
 
 
273 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  30.41 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  27.91 
 
 
316 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  32.94 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  29.95 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  30.43 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  30.08 
 
 
341 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  34.64 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1726  aminoglycoside phosphotransferase  31.72 
 
 
308 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000439943  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1993  serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 
328 aa  42  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>