42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0988 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 291 aa  547  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  45.05 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  36.29 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  36.97 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 		 316 aa  85.5  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  33.19 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  43.48 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4715  hypothetical protein  34.28 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4801  hypothetical protein  34.28 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5100  hypothetical protein  34.4 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.29 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  28.16 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  33.98 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  32.72 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  32.14 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2520  serine/threonine protein kinase  33.93 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.549925  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  32.06 
 
 		 288 aa  49.3  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1613  serine/threonine protein kinase  46.75 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  31.13 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  31.55 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  30.62 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0059  serine/threonine protein kinase  61.76 
 
 		 327 aa  45.8  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.39318  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0087  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  29.86 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  31.05 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  31.77 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0362  serine/threonine protein kinase  46.3 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  61.76 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4360  serine/threonine protein kinase  46.3 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  33.95 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  29.82 
 
 		 517 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0552  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 360 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0224  serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  29.11 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0212  serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 		 346 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0405  serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 		 346 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2605  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 327 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00251914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3271  serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2936  serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2153  serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3411  serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3619  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>